聚氨酯防水涂料的基本原理是以合成高分子聚合物膠乳改性以水泥和石英砂為主要成份的無機膠凝材料，所形成的涂膜在基本保持水泥膠凝材料的高強度、強耐水性的特性基礎上，盡可能提高其柔性(即延伸率)。同時聚合物膠乳也帶來了負作用，即硬度的下降和長期耐水性及耐老化性能的減弱，其負作用大小與所用膠乳的種類和摻量密切相關，目前市場上用于JS涂料的乳膠主要有兩類——聚丙烯酸酯膠乳和聚乙烯-醋酸乙烯酯膠乳。前者的改性能力優于后者，達到相同性能的用量前者亦顯著少于后者，其負作用亦明顯小于后者。但大多數人錯誤的認為聚氨酯防水涂料應該是膠乳用量越大越好，在選購不同廠家產品時以相同價格為準比較哪家廠品的膠乳用量大而選之。因此，有些廠家或商家為了表明其產品膠乳用量大，就把購進的膠乳原料摻水后再配制聚氨酯防水涂料，其產品質量與真正的聚氨酯防水涂料相去甚遠，更有甚者，有些施工隊伍在低價承包防水工程后，就采用市購的聚醋酸乙烯酯膠乳或聚乙烯醇膠水摻配后施工，其后果不堪敘述，嚴重地損壞了聚氨酯防水涂料的聲譽。目前建筑工程上大量使用的聚氨酯防水涂料中，真正采用聚丙烯酸膠乳的不到10%，這是聚氨酯防水涂料滑入“低劣”產品行列的主要原因。